Algenreaktoren köännen sowohl intern im Technikbecken oder Extern ausserhalb vom Technikbecke mit einer separaten Pumpe oder als Bypass betrieben werden.
In einem Algenreaktor können Alge im Meer- und Süsswasseraquarium kultiviert werden, weiterhin wird das Wasser gefiltert, Nitrat und Phosphat reduziert und das Wasser mit Sauerstott angereichert.